整顿军纪：严令禁止明军士兵劫掠百姓、私占财物，处决违纪者以儆效尤，重塑 “王师” 形象，避免重蹈叛军扰民覆辙。

补充军备：清点莱州库存兵器、粮草，修复或补充攻城器械、火药等物资，为后续军事行动做准备。

3. 重构胶东防务体系

加强城防：修复莱州城墙、护城河，增设烽火台、炮台，部署守军主力，将其作为胶东地区的军事枢纽。

联防部署：与登州、青州等周边郡县守军建立联防机制，互通讯报，避免单点突破。例如，可派副将驻守险要关隘，控制海陆交通要道，防止后金从海上入侵或叛军余部逃窜。

裁撤冗余兵力：对于战斗力薄弱的地方团练或卫所兵，可淘汰老弱，选拔青壮编入正规军，提升整体作战能力。

4. 重建行政体系

任命官吏：奏请朝廷选派廉洁能干的州县官员，填补战乱中空缺的职位（如莱州知府、知县），重建地方行政机构，恢复赋税、户籍、司法等职能。

清查田亩与户籍：战乱后人口流失严重，需重新丈量土地、登记户籍，减免战乱期间积欠的赋税，鼓励流民返乡耕种，恢复农业生产。

火神军领了维持莱州城治安的任务，朱督师应该知道火神军的名声好，火神军确实也没辜负朱督师的期望，制止了几起乱兵骚扰百姓的事件，莱州城的治安很快得到恢复。